Оценен потенциал применимости мультихромофорного соединения, состоящего из восьми хромофоров 4,4-дифтор-4-бор-3а,4а-диаза-s-индацен (BODIPY), связанных через алифатический спейсер с силоксановым ядром, для мониторинга параметров мембран в живых эукариотических клетках. Указанное соединение обладает значительным сольватохромизмом за счет внутримолекулярных взаимодействий хромофоров.
Обнаружено, что параметры внешней среды существенно влияют на флуоресцентные свойства красителя, в частности, на время жизни флуоресценции. Это позволило использовать его для мониторинга параметров мембранных структур клетки методом микроскопии с визуализацией времени жизни флуоресценции (fluorescence lifetime imaging microscopy, FLIM).
Идентификаторы и классификаторы
- Префикс DOI
- 10.61011/OS.2024.04.58212.26-24
Флуоресцентные красители в настоящее время широко используются для изучения процессов, протекающих в живых системах [1]. Для визуализации отдельных компартментов клеток и определения локализации отдельных белков в клетке обычно нужны стабильные и яркие флуорофоры, нечувствительные к параметрам внешней среды. Однако соединения, оптические свойства которых зависят от внешних условий, также востребованы в клеточной биологии, так как позволяют следить за отдельными показателями клетки. К примеру, в литературе описано множество сенсоров неорганических ионов, органических низкомолекулярных соединений, ферментов и т. д. [2]. Флуоресценция таких сенсоров меняется при разной концентрации аналита. Получены
даже соединения, позволяющие измерять вязкость в отдельных компартментах клетки, а также термочувствительные зонды. Они обычно основаны на соединениях, квантовый выход и время жизни флуоресценции которых меняются в зависимости от подвижности отдельных элементов хромофорой системы друг относительно друга.
Ярким примером таких соединений являются стирильные производные [3–5] и гемицианины [6,7], у которых ароматические циклы разделены двойными связями, а
также молекулярные роторы на основе 4,4-дифтор-4-бор3а,4а-диаза-s-индацена (BODIPY) [8–10] (рис. 1). При увеличении вязкости среды или уменьшении температуры квантовый выход флуоресценции этих соединений растет за счет уменьшения колебательной подвижности хромофора. Особую популярность в последнее время приобрели материалы с эмиссией флуоресценции, вызванной агрегацией (AIE, aggregation-induced emission). Обычно агрегация красителей приводит к тушению (ACQ, aggregation-caused quenching), однако в случае соединений с AIE за счет, с одной стороны, стерических ограничений на взаимодействия π-систем хромофоров друг с другом, а с другой стороны, за счет ограничения колебаний в сконденсированном состоянии происходит рост квантового выхода флуоресценции [11,12]. Недавно нами была синтезирована серия соединений, содержащих несколько (от 2 до 8) флуорофоров BODIPY, связанных с силоксановым ядром через алифатический спейсер [13]. Они хорошо растворимы во многих органических растворителях, однако за счет близкого расположения хромофоров происходит их агрегация. Это проявлялось, с одной стороны, в виде эффектов, похожих на ACQ — квантовый выход флуоресценции уменьшался при увеличении числа хромофоров в молекуле. С другой стороны, при этом наблюдалось появление новых полос флуоресценции, связанных, вероятнее всего, с образованием эксимеров — что можно охарактеризовать как AIE. Флуоресцентные свойства этих олигомерных красителей
сильно зависели от параметров внешней среды (растворителя), которая определяла баланс эффектов ACQ-AIE в молекуле. Наиболее выраженными эти эффекты были в красителе с восемью хромофорами BODIPY (octaBDP, рис. 2, a). За счет высокой гидрофобности это соединение должно хорошо накапливаться в мембранных структурах клетки. В настоящей работе мы оценили потенциал применимости octa-BDP для мониторинга параметров мембран в живых клетках.
Список литературы
- E.A. Specht, E. Braselmann, A.E. Palmer. Annu. Rev. Physiol., 79 (1), 93 (2017). DOI: 10.1146/annurev-physiol-022516-034055
- V.I. Martynov, A.A. Pakhomov. Russ. Chem. Rev., 90 (10), 1213 (2021). DOI: 10.1070/RCR4985
- L. Yuan, D. Wang, S. Shan, J. Chen, W. Huang, G. Han, X. Tian, R. Zhang, Z. Zhang, Z. Liu. Anal. Methods, 13 (28), 3181 (2021). DOI: 10.1039/D1AY00366F
- M.A. Ustimova, P.A. Chernikova, N.E. Shepel, Y.V. Fedorov, O.A. Fedorova. Mendeleev Commun., 30 (2), 217 (2020). DOI: 10.1016/j.mencom.2020.03.029
- H. Xiao, P. Li, B. Tang. Chem. — Eur. J., 27 (23), 6880 (2021). DOI: 10.1002/chem.202004888
- X.-Z. Yang, B. Xu, L. Shen, R. Sun, Y.-J. Xu, Y.-L. Song, J.-F. Ge. Anal. Chem., 92 (5), 3517 (2020). DOI: 10.1021/acs.analchem.0c00054
- P. Luo, M. Wang, W. Liu, L. Liu, P. Xu. Molecules, 27 (22), 7750 (2022). DOI: 10.3390/molecules27227750
I. Lopez-Duarte, T.T. Vu, M.A. Izquierdo, J.A. Bull, M.K. Kuimova. Chem. Commun., 50 (40), 5282 (2014). DOI: 10.1039/C3CC47530A - M. Kubankova, P.A. Summers, I. Lopez-Duarte, D. Kiryushko, M.K. Kuimova. ACS Appl. Mater. Interfaces, 11 (40), 36307 (2019). DOI: 10.1021/acsami.9b10426
- S. Toliautas, J. Dodonova, A. vZvirblis, I. vCiplys, A. Polita, A. Devivsis, S. Tumkevivcius, J. vSulskus, A. Vyvsniauskas. Chem. — Eur. J., 25 (44), 10342 (2019). DOI: 10.1002/chem.201901315
- J. Mei, Y. Hong, J.W.Y. Lam, A. Qin, Y. Tang, B.Z. Tang. Adv. Mater., 26 (31), 5429 (2014). DOI: 10.1002/adma.201401356
- Z. Zhao, B. He, B.Z. Tang. Chem. Sci., 6 (10), 5347 (2015). DOI: 10.1039/C5SC01946J
- A.A. Pakhomov, E.E. Kim, Y.N. Kononevich, D.S. Ionov, M.A. Maksimova, V.B. Khalchenia, E.G. Maksimov, A.A. Anisimov, O.I. Shchegolikhina, V.I. Martynov, A.M. Muzafarov. Dyes Pigments, 203, 110371 (2022). DOI: 10.1016/j.dyepig.2022.110371
- A.A. Pakhomov, I.E. Deyev, N.M. Ratnikova, S.P. Chumakov, V.B. Mironiuk, Y.N. Kononevich, A.M. Muzafarov, V.I. Martynov. BioTechniques, 63 (2), 77 (2017). DOI: 10.2144/000114577
- Y.M. Efremov, L. Shimolina, A. Gulin, N. Ignatova, M. Gubina, M.K. Kuimova, P.S. Timashev, M.V. Shirmanova. Cells, 12 (21), 2583 (2023). DOI: 10.3390/cells12212583
- M. Paez-Perez, M.K. Kuimova. Angew. Chem. Int. Ed., e202311233 (2023). DOI: 10.1002/anie.202311233
- Y. Tang, J. Peng, Q. Zhang, S. Song, W. Lin. Talanta, 249, 123647 (2022). DOI: 10.1016/j.talanta.2022.123647
- J. Yin, M. Peng, W. Lin. Anal. Chem., 91 (13), 8415 (2019). DOI: 10.1021/acs.analchem.9b01293
A. Vyvsniauskas, I. Lopez-Duarte, N. Duchemin, T.-T. Vu, Y. Wu, E.M. Budynina, Y.A. Volkova, E. Penna Cabrera, D.E. Rami rez-Ornelas, M.K. Kuimova. Phys. Chem. Chem. Phys., 19 (37), 25252 (2017). DOI: 10.1039/C7CP03571C
Выпуск
Другие статьи выпуска
Рентгеновская визуализация в темном поле в последние годы нашла применение в различных областях науки и техники, в том числе в медицине, биологии и материаловедении. Обзор посвящен описанию различных методов рентгеновской темнопольной визуализации. Рассмотрены экспериментальные оптические схемы методов, приемы сбора данных и их обработки, перспективность и ограничения их использования. Особое внимание уделено мультимодальным методам, способным отделить сигнал малоуглового рассеяния от абсорбционного и фазово-контрастного сигнала. Ключевые слова: рентгеновские лучи, визуализация, темное поле, мультимодальные методы, интерферометр Тальбота, кристаллический анализатор, рентгеновская решетка, рентгеновская сетка.
Синтез наноструктур перовскита при комнатной температуре посредством переосаждения в присутствии лигандов позволяет точно контролировать их форму и размеры, а легирование определенными ионами позволяет получить дополнительные полосы фотолюминесценции, открывая возможности для настройки их оптических свойств. Представлены методы синтеза органо-неорганических наноструктур перовскита с различной морфологией при комнатной температуре. Путем подбора типа и соотношения лигандов синтезированы нанокристаллы и нанопластины перовскита с химической формулой FAPbBr3. Обработка предварительно синтезированных нанокристаллов перовскита прекурсором MnCl2 при комнатной температуре позволила получить нанокристаллы Mn2+:FAPbClxBr3-x с излучением в двух различных спектральных диапазонах. Ключевые слова: нанокристаллы перовскита, нанопластины перовскита, легирование, дихлорид марганца, фотолюминесценция.
Теоретически исследовано прохождение униполярного полуциклового импульса через слой неравновесной трехуровневой резонансной среды с разными схемами уровней энергии. Показано, что в такой системе исходный униполярный импульс постепенно трансформируется в биполярный за счет образования осциллирующих хвостов на заднем фронте импульса. В то же время в зависимости от конкретной схемы уровней энергии среды может происходить как усиление, так и затухание основного полуциклового всплеска поля с пройденным расстоянием в среде. При этом во всех случаях выполняется правило сохранения электрической площади, но степень униполярности импульса всегда уменьшается по мере распространения в слое среды. Ключевые слова: предельно короткие импульсы, электрическая площадь импульса, униполярные импульсы, взаимодействие излучения с веществом.
На основе численного решения системы уравнений Максвелла-Блоха проведено сравнение динамики решеток разности населенностей и поляризации среды, моделированных в двух- и трехуровневом приближении. Показано, что решетки также возникают и в трехуровневой среде, однако их динамика качественно не отличается от двухуровневой среды при выбранных параметрах модели. Ключевые слова: решетки разности населенностей, полуцикловые импульсы, аттосекундные импульсы, когерентные эффекты, двухуровневая среда.
Теоретически описан класс однонаправленных осесимметрических локализованных импульсов. Установлена эквивалентность их представлений в виде относительно неискажающихся квазисферических волн, в виде интегралов Фурье-Бесселя и в виде суперпозиции плоских волн с волновыми векторами, имеющими положительные проекции на заданное направление. Ключевые слова: локализованные импульсы, однонаправленные импульсы, точные решения.
Выполнено моделирование эффекта когерентного обратного рассеяния на основе уравнения Бете-Солпитера при учете анизотропии с помощью двух различных фазовых функций. Обнаружено, что с ростом анизотропии индикатрисы однократного рассеяния расчеты с фазовой функцией Рэлея-Ганса приводят к более широким угловым пикам когерентного обратного рассеяния, чем расчеты с фазовой функцией Хеньи-Гринштейна. Моделирование когерентного обратного рассеяния методом Монте-Карло на основе фазовой функции Рэлея-Ганса выполнено впервые. На основе альтернативных фазовых функций исследовано влияние понижения длины пространственной когерентности падающего излучения на форму углового пика когерентного обратного рассеяния. Показано, что с уменьшением длины когерентности обе модели приводят к уширению пика, что может быть использовано в биомедицинской диагностике. Ключевые слова: Когерентное обратное рассеяние, моделирование Монте-Карло, уравнение Бете-Солпитера.
Оптимизированы химический состав и структура фотокатализатора ZnO-SnO2-Fe2O3 для сенсорных и медицинских приложений. Фотокаталитические материалы синтезированы жидкостным полимерно-солевым способом, их структура и химический состав исследованы методами рентгенофазового анализа, сканирующей электронной микроскопии, рентгеноспектрального микроанализа, оптической и люминесцентной спектроскопии. Полученные композиты состоят из гексагональных кристаллов ZnO, тетрагональных кристаллов SnO2 и шпинели ZnSn2O4. Ширина запрещенной зоны композитов составляет 3.17-3.24 eV. Кинетические зависимости адсорбции органического диазокрасителя Chicago Sky Blue из растворов на поверхности композитов хорошо описываются кинетическими уравнениями как псевдопервого, так и псевдовторого порядков. Кинетика фотокаталитического разложения красителя в растворах под действием как УФ, так и видимого света хорошо описывается кинетическим уравнением первого порядка. Показано, что добавки серебра позволяют заметно повысить адсорбционные и фотокаталитические свойства материалов системы SnO-SnO2-Fe2O3. Ключевые слова: нанокристаллы, гетероструктура, фотокатализ, адсорбция.
Зарегистрированы спектры люминесценции кристалла YAl3(BO3)4:Cr3+ в спектральном диапазоне запрещённых по спину электронных переходов 2E->4A2 в ионах Cr3+ (14550-14700 cm-1) с высоким спектральным разрешением при температурах 4-300 K. Температурные зависимости отношений интегральных интенсивностей линий R2 и R1, а также N’ и N (предположительно линий переходов 2E->4A2 центра Cr3+ в искажённой вследствие близости некоторого дефекта позиции) хорошо соответствуют распределению Больцмана. На измерении этих отношений может быть реализован ратиометрический термометр с максимумами абсолютной чувствительности при температурах 40.3 и 21.6 K и относительной чувствительностью до 12% K-1. Измерение ширины самой интенсивной спектральной компоненты - линии R1 - может быть способом регистрации температуры в диапазоне от 100 K и выше. Ключевые слова: люминесцентная криотермометрия, кристалл YAl3(BO3)4:Cr3+, фурье-спектроскопия высокого разрешения.
Предложено для измерения реакции зрачка глаза на изменение освещенности использовать инфракрасную подсветку, что позволяет разделить функции воздействия на глаз и регистрации его реакции. Создана соответствующая установка, позволяющая измерять диаметр и интегральную площадь зрачка, а также скорость его сужения. Представлены результаты тестирования установки, свидетельствующие о ее технических возможностях. Ключевые слова: оптические измерения, зрение человека, зрачковая реакция глаза.
Микроскопия на основе эффекта твердотельной иммерсии - это метод ближнепольной визуализации, который позволяет преодолеть дифракционный предел Аббе за счет фокусировки светового пучка на малом расстоянии за линзой с высоким показателем преломления. Он обеспечивает высокую энергетическую эффективность благодаря отсутствию каких-либо субволновых зондов или диафрагм в оптическом тракте. Выгодное сочетание сверхразрешения и высокой энергетической эффективности открывает широкие возможности применения данного метода в различных областях науки и техники. Пространственное разрешение микроскопии на основе эффекта твердотельной иммерсии в основном ограничено значением показателя преломления линзы, при этом более оптически плотные линзы обеспечивают более высокое разрешение. В настоящей работе объемный кристалл рутила (TiO2) впервые используется в качестве материала для иммерсионной линзы, которая обеспечивает впечатляющий показатель преломления ~10 в терагерцовом диапазоне. Это самое высокое значение показателя преломления, когда-либо использовавшееся в микроскопии на основе эффекта твердотельной иммерсии. Для создания микроскопа использовались лавинно-пролетный диод в качестве источника непрерывного излучения на частоте 0.2 THz (длина волны λ=1.5 mm) и детектор Голея. Экспериментальные исследования показали, что пространственное разрешение разработанного микроскопа находится в пределах 0.06-0.11λ. Это самое высокое разрешение, когда-либо зарегистрированное для любой оптической системы на основе эффекта твердотельной иммерсии. Ключевые слова: терагерцовые технологии, терагерцовые оптические материалы, рутил, высокий показатель преломления, ближнепольная микроскопия, микроскопия на основе эффекта твердотельной иммерсии, сверхразрешение.
Рассмотрены два метода анализа изображений, полученных с помощью оптической когерентной томографии (ОКТ): анализ коэффициента ослабления и спекл-структур изображений применительно к дифференциации интактных тканей и опухолей головного мозга крыс. Использована модель глиомы 101.8. Для извлечения информации из спекл-структур был применен метод вейвлетного анализа ОКТ-изображений и посчитана мощность локальных флуктуаций яркости в спеклах. При помощи линейного дискриминантного анализа оценивалась эффективность разработанного подхода, состоящего из двух методов, на основе значений чувствительности, специфичности и точности при дифференциации модели глиомы и интактных тканей. Результаты исследования показали преимущества разработанного метода анализа ОКТ-изображений для нейрохирургии. Ключевые слова: оптический когерентный томограф, глиома, вейвлетный анализ, линейный дискриминант Фишера, спекл-структуры, коэффициент ослабления.
Исследованы спектральные свойства растворенного органического вещества природной воды двух частей искусственно отделенного от Белого моря водоема — губы Канда: морского плеса и меромиктического Федосеевского плеса. Для сравнения проанализированы данные для естественных меромиктических водоемов — озера Елового, Трехцветного, Лагуны на Зеленом мысе. Для проб воды с разных горизонтов получены спектры поглощения, спектры флуоресценции и зависимости квантового выхода флуоресценции от длины волны возбуждения в диапазоне изменения длины волны возбуждения 250−500 nm. Построены зависимости длины волны максимума испускания от длины волны возбуждения и рассчитана величина “ синего сдвига“ — смещения максимума полосы испускания в коротковолновую сторону. Показано, что интенсивность флуоресценции растворенного органического вещества в Федосеевском плесе выше, чем в морском, при этом зависимость квантового выхода флуоресценции от длины волны возбуждения в обеих частях Канда-губы имеет качественно сходный характер, но различается абсолютными значениями.
В естественных меромиктических водоемах эта зависимость имеет аналогичный характер, также различаясь абсолютной величиной квантового выхода флуоресценции, что говорит о разном соотношении ароматических и алифатических органических соединений. Таким образом, выявлены различия в спектрально-оптических свойствах растворенного органического вещества двух частей искусственно отделенного водоема и природных водоемах, изолированных от Белого моря. Спектрально-оптические характеристики водной толщи морских заливов, естественно или искусственно отделенных от основного морского бассейна, могут служить объективным индикатором трофического (экологического) состояния водоема.
Исследовано взаимодействие бактериохлорофилла с различными полярными растворителями, такими как вода, метанол, этанол и изопропанол. Проведены расчеты с использованием программного пакета Gaussian и базиса 6-31G (d) для определения структуры бактериохлорофилла и свойств его водородных связей. Полученные результаты подтверждают значимость водородных связей при взаимодействии бактериохлорофилла е с полярными растворителями. Данные растворители чаще всего используются для экстракции бактериохлорофиллов из бактериальных клеток, поэтому настоящая работа полезна для разработки методов количественного определения бактериохлорофилла e в бактериальных клетках или в водоёмах.
Исследованы индукционные изменения флуоресценции листьев растений картофеля и бархатцев после обработки клубней (картофель) и опрыскивания вегетирующих растений (бархатцы) препаратом “ ЭпинЭкстра“ и кремнийсодержащим жидким органическим удобрением “ Силиплант“. Использование этих препаратов позволило компенсировать негативные воздействия на фотосинтетический аппарат растений, связанные с обработкой клубней картофеля фунгицидом “ Максим“, а также выдерживанием растений бархатцев при температуре 5◦С в течение трех суток.
Представлены результаты исследования по оценке состава разных форм аллогенного коллагенсодержащего материала (гидрогеля) в качестве потенциального компонента биочернил в перспективном направлении тканевой инженерии с помощью оптических методов (рамановской и ИК спектроскопии). В результате проведенных исследований с помощью метода спектроскопии комбинационного рассеяния (КР) установлено, что в негидролизованной форме коллагена относительное содержание пролина и гидроксипролина меньше, чем в гидролизованной форме, что может говорить о нарушениях структурной организации коллагенсодержащего материала (по спектральным особенностям пролина и гидроксипролина). На основе дисперсионного анализа был разработан алгоритм идентификации разных форм аллогенного коллагенсодержащего материала с помощью дерева решений. Установлено, что с помощью методов рамановской и ИК спектроскопии можно проводить экспресс-анализ состава и типов коллагеновых материалов, а также контролировать степень денатурации коллагена при разработке биочернил. Ключевые слова: рамановская спектроскопия, ИК спектроскопия, алгоритм идентификации коллагенов, гидрогель, биочернила, коллагенсодержащий материал, дисперсионный анализ.
Издательство
- Издательство
- ФТИ им. А.Ф. Иоффе
- Регион
- Россия, Санкт-Петербург
- Почтовый адрес
- 194021, Санкт-Петербург, Политехническая ул., 26
- Юр. адрес
- 194021, Санкт-Петербург, Политехническая ул., 26
- ФИО
- Иванов Сергей Викторович (Руководитель)
- E-mail адрес
- post@mail.ioffe.ru
- Контактный телефон
- +7 (812) 2972245
- Сайт
- https://www.ioffe.ru