Проблема устойчивого водопользования становится все более актуальной в свете растущего антропогенного давления и изменения климата, особенно для южных районов России, испытывающих дефицит воды. В ходе исследования были определены приоритетные области для повышения экологической устойчивости, также были рассмотрены основные причины антропогенного воздействия и слабые стороны региональных систем управления водными ресурсами. Особое внимание уделяется необходимости внедрения водосберегающих технологий, усиления контроля за качеством водных ресурсов и налаживания межотраслевых связей между государственным, частным и научным секторами. Имеются данные, подтверждающие действия, предпринятые для улучшения регионального управления водными ресурсами с учетом концепций устойчивого развития. На основе предложенного подхода могут быть основаны программы планирования управления водными ресурсами, направленные на обеспечение водной безопасности, восстановление природного баланса и снижение экологических рисков в южных регионах Российской Федерации.