Цель статьи — обобщение существующих методологических проблем при ведении бухгалтерского учета затрат и калькулирования себестоимости высокотехнологичной промышленной продукции гражданского назначения, с которыми сталкиваются промышленные предприятия, вступающие в сферу выполнения государственного оборонного заказа. Обосновывается объективная необходимость построения системы бухгалтерского учета по государственным контрактам, исходя из специфики деятельности компании, наукоемкости продукции и высокой степени автоматизации производственных процессов. Сделан вывод о том, что инструменты цифровизации являются ключевым звеном в решении задач оперативного и объективного калькулирования себестоимости продукции, выделены принципы и целевые параметры построения системы бухгалтерского учета при исполнении государственных контрактов в условиях цифровой экономики.