В результате изменения условий обитания в Азовском море применение классической реализации площадного метода в последние годы является затруднительным. Представлена модифицированная доработка площадного метода оценки запасов водных биоресурсов на основе процедуры непараметрического бутстрепа. Апробация нового способа расчёта выполнена относительно классической методики площадного метода для запасов азовской хамсы, тюльки, камбалы калкан и черноморско азовской сельди по данным собранным в 2022 г. Сравнение результатов оценки запаса классическим способом и при помощи бутстрепа не указывает на наличие значимых отклонений в серединных оценках: максимальное отклонение между рассматриваемыми способами составило 3,75%. Различия в ширине доверительных интервалов для разных способов оценки запаса не является существенным. Наиболее значимые различия отмечены при сравнении классического метода способом расчёта BCА (что обусловлено спецификой коррекции смещений этого метода). Представленный усовершенствованный способ оценки запасов через процедуру бутстрепа позволяет получить статистически обоснованные оценки, их доверительные интервалы и выполнить диагностику надёжности исходных данных. Отсутствие значимых различий в результатах классического и предлагаемого способа свидетельствует о возможности применения классического метода даже в условиях значимых отклонений от нормальности исходных выборочных совокупностей. Методическое требование отсутствия значимых отклонений от нормального закона распределения к классическому методу, вероятно, является избыточным.