Оценено качество воды на российском участке реки Селенги по нормируемым показателям общей численности бактерий и численности органотрофных бактерий. Воды р. Селенги характеризовались очень высокой общей численностью бактерий (до 11 млн кл/мл), но низкой численностью органотрофных бактерий (до 264 КОЕ/мл). Наибольшие значения наблюдались в районе г. Улан-Удэ, что, как и повышенное количество углеводородокисляющих бактерий, сигнализирует о негативном влиянии города на качество воды. Речная вода по данным показателям оценена как «грязная» (общая численность) и «очень чистая» (численность органотрофов). По отношению к общей численности и численности органотрофов вода оценена как «чистая». По низкому количеству углеводородокисляющих и отсутствии фенолокисляющих бактерий можно судить об отсутствии специфических загрязнителей.